В 1975 году произошло знакомство с классической гомеопатией, изучение и первые шаги в практическом применении при участии старейшего ленинградского гомеопата И.Д. Гуревича.

В период обучения в 1ЛМИ им. И.П. Павлова приступил к более активному и широкому применению гомеопатического метода под руководством классического гомеопата и невролога, к.м.н., доцента кафедры неврологии ЛенГИДУВа Т.Л. Шалагиной.

После окончания интернатуры приступил к самостоятельной широкой практике врача-гомеопата. Стаж в гомеопатии — более 40 лет.

В 1992 году защитил кандидатскую диссертацию по специальности «Пульмонология» на тему: «Анализ цитогенетического действия иммуномодулирующей терапии у больных бронхиальной астмой».

Работал районным врачом-аллергологом, затем в клинике Первого Ленинградского медицинского института на кафедре госпитальной терапии с курсом аллергологии и иммунологии, где совмещал клиническую, преподавательскую и научную деятельность.

Преподавательская деятельность включала все разделы терапии внутренних болезней с особым акцентом на аллергологию — на впервые созданном в Санкт-Петербурге курсе аллергологии и клинической иммунологии.

2014–2024 гг. — доцент кафедры пульмонологии ГБОУ ВПО «Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова».

С 2018 года является членом Европейского Респираторного общества, с 2020 года — член Европейской Академии Аллергологии и Клинической Иммунологии (EAACI).

Автор более 140 опубликованных научных трудов, соавтор 6 монографий и 10 учебных и учебно-методических пособий для врачей и преподавателей медицинских вузов.

Практикуя метод классической гомеопатии, А.Е. Линцов комбинирует в лечении два основных подхода: плюрализм — преимущественно на начальных этапах лечебного процесса и уницизм — на более поздних этапах терапии. При наличии лечебной необходимости специалист дополняет лечебный комплекс компонентами фитотерапии и психотерапии.